Деятельность Комитета по аудиту заключается в содействии повышению эффективности системы внутреннего контроля, управления рисками и корпоративного управления, а также в осуществлении надзора за службой внутреннего аудита, обеспечении адекватного применения стандартов бухгалтерского учета, наблюдении за качеством финансовой отчетности и оценке соответствия работы внешнего аудитора стандартам, установленным законодательством Кыргызской Республики. 

В 2019 году Комитетом по аудиту было проведено 21 заседание, на которых были рассмотрены материалы о деятельности Службы внутреннего аудита, финансовой отчетности Национального банка, изменений в учетной политике, мониторинги исполнения рекомендаций внутреннего и внешнего аудита, обзор системы внутреннего контроля. Комитет по аудиту на полугодовой основе представлял информацию о своей деятельности на рассмотрение Правления Национального банка. Член Комитета по аудиту независимый эксперт принимал участие в процедуре выбора внешнего аудитора Национального банка. В целях обеспечения гарантии независимости внешних аудиторов Комитетом по аудиту проведены встречи с ответственными представителями внешних аудиторов по вопросу аудита финансовой отчетности за 2018 год.